基于對人類身體中鮮為人知的部分，即微生物群的了解，人們對過敏和帕金森病的認識也有迅速的轉變。同時，該研究領域甚至提出了“人類”意味著什么的問題，以及由此可能產生的創新療法。

　　馬克斯普朗克研究所微生物組科學系主任露特 萊(Ruth Ley)教授說：“這些微生物對人的健康至關重要。”無論你洗漱得多干凈，幾乎身上的每個角落還是會被微生物覆蓋。這些微生物包括細菌、病毒、真菌和古生菌(最初被誤分類為細菌的生物體)，它們主要集中在我們處于缺氧環境下的腸的深處。

　　來自加州大學圣地亞哥分校的羅布 奈特(Rob Knight)教授說：“這些微小生物徹底改變著我們的健康狀態，它們以一種我們最近才了解到的方式進行改變。”這是一種重新思考微生物世界的新方式。迄今為止，我們與微生物的關系基本上處于對抗狀態。

　　抗生素和疫苗一直是針對天花、結核分枝桿菌及耐甲氧西林金黃色葡萄球菌 (MRSA)等病毒的利器，這已經挽救了大量生命。但一些研究人員擔心，人們對抗病毒的同時，也會對“有益細菌”造成了無法估量的損害。

　　奈特教授說：“過去50年來，我們在消除傳染病方面做得非常出色。但我們自身免疫疾病和過敏癥也在增加，這種變化正是由于我們成功對抗病原體所致，現在已經導致了一系列我們不得不面對的疾病。”

　　微生物組也與某些疾病有關，包括炎癥性腸病、帕金森病、癌癥藥物的功效、甚至是抑郁癥和自閉癥。

　　另外，家族史和生活方式選擇對于肥胖顯然有一定影響，漢堡和巧克力的飲食會增加人類的肥胖風險，影響消化道中微生物的類型。奈特教授對老鼠進行了實驗，確保這些老鼠身上完全沒有微生物的存在。

　　奈特教授說：“我們能夠證明，如果你讓精瘦和肥胖的人將其糞便中的細菌移植到老鼠身上，那么你就可以根據它的微生物群體使老鼠變瘦或變胖。但現在的問題是，這是否可以適用于人類”。報道稱，這是該領域的巨大希望，微生物可能會被作為一種新的醫學治療方式——“以菌為藥”。