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遠慕生物:新冠肺炎疫情把科研推上“云端”

2020-03-18 11:20 作者:洛辰 來源:上海遠慕生物試劑

美國威斯康星國家靈長類動物研究中心的戴夫·奧康納清晨收到在倫敦的一名合作伙伴發來的論文預印本。這項研究在中國完成,兩人通過企業協同云端辦公軟件Slack討論了一上午。下午2點,奧康納打開高清會議系統GoToMeeting,和多個機構的研究人員討論改進研究計劃,他們希望構建一個靈長類動物模型來研究新冠病毒。

疫情之下,科研人員實地研究與交流受限。但很多人如奧康納一樣,在即時交流軟件和科研共享平臺幫助下,紛紛開啟“云端”科研模式。

“云端”科研新潮流

受疫情影響,一些學術會議已經取消,但思想碰撞并未因疫情停歇。美國艾滋病年會、第八屆國際表征學習大會等更多會議已轉到“云端”,哈佛大學、約翰斯·霍普金斯大學等機構也召開網絡研討會“會診”疫情。

“上周我使用WebEX開會,全世界近60名專家參與,包括中國專家,”奧康納對新華社記者說,“挑戰只有時區不同。”

協同辦公軟件便于多人科研項目管理,即時通信軟件保障隨時交流,遠程會議系統可即時開啟全球頭腦風暴。“這種即時全球交流讓分享信息更容易。”奧康納說。很多人建議“云會議”在疫情后繼續,對節能減排也有貢獻。

不過,由于大批研究人員無法返校,依賴實驗的學科就沒法在“云端”進行了。中國清華大學醫學院胡小玉教授在美國細胞出版社微信公眾號上寫道:“從1月底迄今濕實驗基本停頓,到崗人員僅能做到維持現有實驗體系不崩塌,例如小鼠有飯吃,細胞泡液氮,鋼瓶存口氣而已。”
 

雖困難重重,但胡小玉覺得可利用這段時間修煉內功:包括每周一次的遠程組會和小組討論,文獻閱讀與分享以及寫作指導,“期待一朝功成,重返實驗室時,個個真氣充盈、出招迅猛”。

中國的清華大學、武漢大學等高校已開始遠程授課。“近4000門課全部上線,可能是歷史首次。”清華大學藥學院院長丁勝教授對記者說。美國斯坦福大學、華盛頓大學等高校也轉為線上教學。

多位教師說,直播授課最大挑戰在于缺乏學生即時反饋,各種操作也影響教學連貫性,需慢慢適應。不過,大眾可在公共視頻平臺和在校生一起聽課,算是疫情中的“福利”。

數據共享再加深

面對疫情,全球科研爭分奪秒,論文預印本網站是快速分享新成果的平臺,數據和研究加速開放共享成為新趨勢。

預印本是指未經同行評議就上傳至公共平臺的論文草稿,省去了正式發表的審稿流程。美國冷泉港實驗室出版社運營著兩大生物醫學預印本網站BioRxiv和MedRxiv。社長約翰·英格利斯說,兩個網站每天收到約10篇與新冠病毒有關的論文。

“相比以往疫情,這次疫情中科研人員對研究成果更加開放,這既因為資助機構和期刊等主張透明性,也由于更有效利用了新技術,更多科研人員在網上隨時分享想法、圖片等,分享數據是正確的事。”奧康納說。

他回憶,2016年寨卡病毒暴發期間,在預印本網站發布研究結果會影響在期刊發文。而這一次,所有同行評議期刊不約而同支持將成果先發布在預印本網站。很多期刊也提前在網站公開論文初稿。

截至北京時間15日早8時,以“新冠病毒”為關鍵詞在BioRxiv和MedRxiv上搜索,可分別找到393篇和373篇論文。

奧康納說,他讀過的所有新冠病毒相關文本都來自預印本網站,這有利有弊,“同行評議很耗時,延遲了結果發布,但完全透明的流程可能讓危害公眾的草率科研成果獲得平臺”。印度學者關于新冠病毒與艾滋病病毒關系的文章在BioRxiv發布后引發廣泛質疑并撤稿就是例證。

“新技術或應用并非完美,預印本和期刊互為補充。預印本加速科技交流,未來也會不斷優化。”丁勝說。無論是中國科研人員快速共享病毒基因序列、診療方案,還是期刊愈加開放,都是在試圖及時溝通科學發現,令全球受益。

由丁勝擔任主任的全球健康藥物研發中心,也將其高通量篩選平臺、化合物分子庫等開放給全球科研人員,共同加速針對新冠病毒的藥物研發。一家美國人工智能藥物研發公司就利用平臺數據,快速完成了藥物建模。

社交媒體也推動了科學信息共享。最早激活奧康納“科研雷達”的,是新年伊始一條武漢的病毒性肺炎疫情推特。他的實驗室推特會分享成果接受公眾檢驗。

“與公眾溝通科研工作非常重要。就這次疫情而言,要讓公眾清晰了解新藥物和疫苗研發真正投入應用所需時間,確保公眾對此不會預期過高。”參與新冠疫苗研發的英國帝國理工學院醫學院教授羅賓·沙托克說。

在多數科研人員看來,疫情之后,這種開放共享的科研文化也應當繼續。

“與新冠肺炎疫情一樣,流感、艾滋病、癌癥和心臟病等其他疾病對人類影響同樣嚴重。我們要將在新冠肺炎研究中分享數據和信息的傳統延續,解決其他科學和醫學挑戰,這將是疫情留下的積極遺產。”奧康納說。

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