內參抗體可用于評價蛋白質免疫印跡法(Western Blot)的效率，比較凝膠中每孔的蛋白上樣量。此類對照可幫助確定樣品間表達水平的差異，以判斷是由細胞裂解物的實際蛋白水平導致，還是由上樣量的差異導致。

內參抗體在目標蛋白的免疫熒光研究中，也可以作為共染的陽性對照。內參抗體分為未標記型和標記型，標記物包括生物素、HRP、FITC、PE、Cy染料和Alexa Fluor染料。
內參抗體種類很多，比如β-actin、β-tubunlin、GAPDH、Vinculin、Lamin B、PCNA等，其選擇常使我們困惑。本文將簡單介紹選擇內參抗體應遵循的五項原則：

一、樣本種屬來源：

首先要考慮實驗樣本來源于什么物種。

1. 哺乳動物的組織或者細胞樣本，通常選擇β-actin、β-tubulin、GAPDH、Lamin B、Histone H3、Na,Katpase等。

2. 植物來源實驗樣本，則可以選擇plant actin、Rubisco等。

3. 其他來源樣本研究較少，所以就應該參照文獻報導，選擇合適的蛋白作為內參。

二、分子量大小：

選擇內參抗體時，應該考慮目的蛋白分子量的大小，一般保證目的蛋白與內參蛋白分子量相差5KD以上。例如，目的蛋白分子量為40KD，此時不適宜選擇β-actin、與GAPDH作為內參，可以考慮選擇α-Tubulin或者β-tubulin作為內參。

三、表達水平：

選擇的內參蛋白需要在待測樣本中是高表達的。常用的內參蛋白是由管家基因高表達的，是細胞發育和維持細胞活力所必須的。例如，細胞核的內參蛋白 PCNA，在 DNA S 期表達，因此對于非增殖細胞不推薦使用。

四、表達因素：

選擇蛋白表達不受實驗變量影響的內參。

●在做多組織多細胞樣本對比表達量時，zui好選用 GAPDH作為內參，因為GAPDH是代謝類蛋白，在活組織中表達比較恒定。而β-Actin和β-Tubulin是結構蛋白，不同組織的細胞結構會有差異性；

●而在某些細胞中，由于組織缺氧、糖尿病等因素會導致GAPDH的表達增高，不適合做內參；

●涉及細胞增殖的相關試驗中，c-Jun由于自身表達變化不適合做內參；

●凋亡實驗時，TBP、Lamin等也不適合作為內參；

●做誘導后樣本或檢測磷酸化等修飾性抗體時，應選擇結構蛋白作為內參，如β-Actin 和β-Tubulin；

●做各種分泌液樣本的時候，如血漿、乳汁、組織液等，由于沒有完整的細胞結構，只能選擇一些分泌蛋白作為內參。