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質粒DNA的提取電泳檢測與純化 @遠慕資料

2020-05-13 11:05 作者:洛辰 來源:上海遠慕生物試劑
1.引言

質粒是細菌細胞中與主染色體共存、可自主復制的一段大多數呈環形的DNA。細菌質粒的相對分子質量大小從1kb至200kb以上不等。一些質粒永遠獨立于染色體之外,另外一些質粒在一定條件下會可逆地整合到寄主染色體上,隨著染色體的復制而復制,并通過細胞分裂傳遞到后代。質粒在基因工程中質粒常被用做基因的載體。目前,已發現有質粒的細菌有幾百種,已知的絕大多數的細菌質粒都是閉合環狀DNA分子(簡稱cccDNA)。

由于質粒分子小、便于分離和提取的特點,在DNA重組中,質?;蚪涍^改造后的質??赏ㄟ^連接外源基因構成重組體,攜帶目的基因進入細菌、動物細胞或植物體內進行擴增與表達,因此質粒是基因工程中一種非常重要的載體。質粒特征的分析已被廣泛用于細菌種屬鑒定、耐藥性、毒力及同源性分析。近年來由于基因芯片技術的出現,質?;蛱结樀拈_發和應用也得到了飛速的發展,所以這就要求我們從宿主細胞中提取高質量的質粒DNA。因此,質粒DNA的提取成為分子生物學實驗室一項最基本的工作。

提取和純化質粒DNA的方法很多,目前常用的有:堿裂解/堿變性法、煮沸法、羥基磷灰石柱層析法、EB-氯化銫密度梯度離心法和Wizard法等。其中,堿變性提取法最為經典和常用,是一種應用最為廣泛的制備質粒DNA的方法,是基于染色體DNA與質粒DNA的變性與復性的差異而達到分離目的,適用于不同量質粒DNA的提取。該方法操作簡單,易于操作,一般實驗室均可進行。提取的質粒DNA純度高,可直接用于酶切、序列測定及分析。

堿變性提取質粒DNA一般包括三個基本步驟:培養細菌細胞以擴增質粒;收集和裂解細胞;分離和純化質粒DNA。

在細菌細胞中,染色體DNA以雙螺旋結構存在,質粒DNA以共價閉合環狀形式存在。細胞破碎后,染色體DNA和質粒DNA均被釋放出來,但是兩者變性與復性所依賴的溶pH值不同。在pH12.6的堿性條件下,染色體DNA的氫鍵斷裂,雙螺旋結構解開而變性;質粒DNA的大部分氫鍵斷裂,但超螺旋共價閉合環狀的兩條互補鏈不會完全分離。當用pH值4.8的KAc(或NaAc)高鹽緩沖溶液調節堿性溶液至中性時,變性的質粒DNA可恢復原來的共價閉合環狀超螺旋結構而溶解于溶液中;但染色體DNA不能復性,而是與不穩定的大分子RNA、蛋白質-SDS復合物等一起形成纏連的、可見的白色絮狀沉淀。這種沉淀通過離心,與復性的溶于溶液的質粒DNA分離。溶于上清液的質粒DNA,可用無水乙醇和鹽溶液,使之凝聚而形成沉淀。由于DNA和RNA性質類似,乙醇沉淀DNA的同時,也伴隨著RNA沉淀,可利用RNaseA將RNA降解。質粒DNA溶液中的RNaseA以及一些可溶性蛋白,可通過酚/氯仿抽提除去,最后獲得純度較高的質粒DNA。

電泳是帶電物質在電場中向著與其電荷相反的電極移動的現象。各種生物大分子在一定pH條件下,可以解離成帶電荷的離子,在電場中會向相反的電極移動。凝膠是支持電泳介質,它具有分子篩效應。含有電解液的凝膠在電場中,其中的電離子會發生移動,移動的速度可因帶電離子的大小、形態及電荷量的不同而有差異。利用移動速度差異,就可以區別各種大小不同的分子。因而,凝膠電泳可用于分離、鑒定和純化DNA片段,是分子生物學的核心技術之一。

凝膠電泳技術操作簡單而迅速,分辨率高,分辨范圍極廣。此外,凝膠中DNA的位置可以用低濃度熒光插入染料如EB染色直接觀察到,甚至含量少至20pg的雙鏈DNA在紫外激發下也能直接檢測到。

溴化乙錠(EB)是一種具扁平分子的核酸染料,可以插入到DNA或RNA分子的堿基之間,并在300 nm波長的紫外光照射下放射出熒光,所以可用來顯現凝膠中的核酸分子。在適當的染色條件下,熒光的強度是同DNA片段的大?。ɑ驍盗浚┏烧取?/div>
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