提純蛋白質后，需要測定其最小抑菌濃度（MIC），有文獻提到根據MIC測得的結果計算抑菌率：

抑菌率（%）= (陽性對照OD值—試驗OD值) / (陽性對照OD值—陰性對照OD值 )X100

樣品的MIC與同性質藥物和一些常用藥物的MIC進行比較才有意義，不能單純通過自己樣品的結果就判斷出高低，并且不能只用一種細菌。要考慮用不同種類的細菌進行實驗，還要做質控。根據抑菌率大小可以判斷是否具有抑菌能力。
 
可參考以下藥敏介紹：

諸多藥敏試驗方法中，肉湯稀釋法是標準方法，瓊脂稀釋法也可認為屬于標準方法。其他任何方法必須與標準方法比較，才能確定可靠性。其他方法之間相互比較沒有太大價值。比較須平行測定耐藥菌株和敏感菌株。耐藥菌株，被評價方法與標準方法的誤差稱極重要誤差，不得大于3%；敏感菌株，被評價方法的誤差稱重要誤差，不大于7%。

不同的藥敏試驗方法，針對不同藥物，可靠性不一樣。如測MRSA須高鹽條件，有的試劑盒中不加鹽，結果不準確，但這不影響腸球菌的測定結果。所以，評價一種方法，應該是有針對性地驗證一種細菌對一種藥物測定結果的可靠性。

質量控制及其校準作用

1、紙片法藥敏試驗

用敏感菌株做質量控制。此外，ATCC25923，ATCC25922，ATCC27853三個菌株還具備校準作用，此點往往被忽視。在NCCLS有關文件中，質量控制一節的第1部分就是講方法的校準。由于培養基和操作的原因，國內大部分實驗室的藥敏試驗沒有經過校準，試驗的準確度差異很大。校準過程中，須注意用適合的參考菌株校準相應菌類的藥敏試驗。如葡萄球菌藥敏試驗用ATCC25923校準；腸桿菌藥敏試驗用ATCC25922校準。

2、篩選法藥敏試驗

必須用耐藥菌株做質量控制，最好是低水平耐藥菌株。MRS篩選試驗以ATCC43300控制。萬古霉素篩選試驗，以ATCC51299控制。

3、稀釋法藥敏試驗

對質量控制要求較高，特別是微量稀釋法，必須做質量控制，否則會出現較大誤差。具體方法須依照NCCLS文件的有關部分。

與不同的菌種和不同的藥物，breakpoint 是不一樣， 對于抗菌實驗和結果解釋，不同的國家有不同的標準，目前國際上最常用的是美國CLSI的標準，差不多每年都會有geng新。其次英國的BSAC標準也有人用，尤其是有些新藥在CLSI上沒有的，可以參考BSAC， 相對于CLSI， BSAC breakpoint geng低一些。