1、真菌鏡檢

是最簡單也是很有價值的實驗室診斷方法。其優點在于簡便、快速，無菌部位的陽性結果可直接確定真菌感染。但是由于陽性率較低，陰性結果亦不能排除診斷。直 接鏡檢對于淺表和皮下真菌感染最有幫助。在皮膚刮屑、毛發或甲標本中發現皮膚癬菌、念珠菌和馬拉色菌的成分可提供對相應真菌病的可靠診斷。如在無菌體液的 直接鏡檢中發現真菌成分常可確立深部真菌病的診斷，例如在腦脊液中檢測到帶莢膜的新生隱球菌酵母細胞，或外周血涂片中檢測到莢膜組織胞漿菌細胞。但一般在 有菌部位則只有發現大量真菌菌絲方才有意義，通過直接鏡檢一般可以區分念珠菌、隱球菌、暗色真菌、毛霉（接合菌）等菌的感染，進一步明確鑒定菌種需要通過 培養鑒定來完成。

2、真菌培養

真菌培養是實驗室檢查中的重要環節，培養出致病真菌是進一步鑒定菌種的前提條件。真菌培養第一步是從臨床標本中培養真菌的初代培養，初代培養后進一步進行 分離純化培養和鑒定培養。不同致病真菌每一步所采用的培養基，培養時間和培養溫度存在一定的差異。常規的真菌培養需要在28-30°C溫度下培養3-4 周，一般初代培養選用沙氏培養基（SDA）或者馬鈴薯瓊脂培養基（PDA），采用試管培養，一般同時培養兩管，其中一管可添加抗生素（氯霉素或慶大霉素均 可）。在培養1周內，應該每天觀察有無真菌生長。一般培養4周后，如果無真菌生長可報陰性。發現培養出真菌，直接挑取少量菌體或者小培養后，用乳酸酚棉蘭 制成涂片顯微鏡下觀察，結合菌落大體形態，典型菌種可直接報告種屬。不典型菌種根據基本表現，采用適當的標準鑒定培養基，標準培養條件培養，必要時要結合 生理學和分子生物學方法進行鑒定。

3、真菌鑒定

對常見致病真菌要掌握的鑒定原則是首先區分酵母菌和霉菌。

如果初代培養基上培養出酵母樣菌落，在鑒定前應進行分離純化。在去除細菌和其他真菌污染，區分混合感染后，對純菌落進行鑒定。酵母菌鑒定主要根據形態學特 征和生理生化特點，按照一定的流程進行。首先根據菌落顏色進行分類。臨床最為常見的是白色或奶白色菌落，這類菌進一步做芽管試驗，若芽管試驗是陽性則為白 念珠菌，若陰性則通過Vitek YBC或API20C及玉米吐溫瓊脂上培養的形態特征來鑒定。另外，還可以應用念珠菌顯色瓊脂、尿素酶試驗等試驗來輔助鑒定。

霉菌的鑒定非常復雜，有許多標準包括形態學特征、溫度耐受性，放線菌酮抗性、雙相性、營養需求、蛋白分解活動以及水解尿素能力等。現代分類學鑒定方法主要 依據分生孢子的個體發生過程結合其他特征來進行鑒定。初代培養后根據形態學特征一般可鑒定到屬的水平，再依據不同真菌的鑒定要求，采用標準培養基和培養條 件進一步完成菌種鑒定。例如：曲霉屬鑒定時需要采用標準培養基，即察氏培養基和麥芽瓊脂，25℃培養7天后與曲霉形態鑒定檢索表對應得到正確的結果。