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你還搞不清楚病毒載體的用法?

2021-11-18 10:06 作者:洛辰 來源:上海遠慕生物試劑
基因表達載體是廣大科研人員普遍需要的研究工具,而病毒載體憑借其優(yōu)良效能則越來越成為最受歡迎、也最為普遍的基因表達載體。然而病毒載體也分為好幾類,不同實驗類型、不同研究目的、不同“受體”性質需要我們準確評估與選擇。因此,詳細了解不同病毒載體的相關知識是我們科研人員必須掌握的。本文詳細介紹了常見病毒載體的原理、特點和適用范圍。


一、慢病毒載體慢病毒(Lentivirus)屬于逆轉錄病毒的一種,有由于其感染潛伏期較長,臨床癥狀發(fā)展緩慢,被稱為慢病毒。而慢病毒載體則是在慢病毒的基礎上改變重組其構成原件,進而在去除其生物危害性的同時,利用其高感染等性能表達目的基因。人類免疫缺陷病毒(HIV)是常見的慢病毒載體改造原型。如下以HIV中最為常見的HIV-1型:

HIV-1為雙鏈RNA病毒,主要組分包含三種重要病毒核心基因:gag(編碼結構蛋白或稱為核心蛋白),pop(編碼復制相關酶類),env(編碼包膜糖蛋白);調節(jié)基因:tat(轉錄控制)和rev(表達調節(jié));四個輔助基因:vif、vpr、vpu、nef(作為毒力因子參與宿主細胞的識別和感染);兩端為長末端重復序列LTR (內含復制所需的順式作用元件)。

第一代慢病毒載體為雙質粒系統(tǒng),基本保留了HIV的所有組件,產毒滴度低,復制缺陷,且存在產生復制能力的活性HIV病毒的可能;第二代慢病毒載體為三質粒系統(tǒng),分為包裝質粒、包膜質粒和載體質粒,其中使用水泡性口炎病毒糖蛋白(VSV-G)基因替代env基因,拓寬了病毒的感染宿主細胞范圍,雖然三質粒降低了病毒重組的可能,但是由于其依然保留HIV大部分附屬基因,產生活性HIV依然存在可能;第三代慢病毒載體則去除了HIV病毒所有輔助序列,只保留核心的3個基因(gag、pol、rev),病毒RNA不能轉錄,故意外重組的可能性很低;第四代慢病毒載體為四質粒系統(tǒng),即將病毒核心基因分散在多個質粒中(pGag/Pol、pRev、pVSV-G和載體質粒),同時去除tat,故病毒重組、產生活性病毒的可能進一步降低,同時四質粒系統(tǒng)中的載體質粒中可以包含可誘導基因,使得該基因表達系統(tǒng)可以條件性調控。

慢病毒載體感染能力強、且宿主廣泛(分裂和非分裂細胞);能夠整合進宿主DNA且篩選后穩(wěn)定遺傳;表達潛伏期短,一般細胞24h-48h、體內96小時可表達;慢病毒載體可以插入組織特異性啟動子或增強子;慢病毒攜帶基因的長度大致無5kb以內。由于慢病毒依然是HIV來源,自然宿主是人,依然存在潛在的生物毒性,故操作時避免直接接觸人體。慢病毒載體適合常見類型的體外研究(細胞),包括過表達、敲除、敲低都基因干預操作,但慢病毒載體不適合于體內研究,因為其滴度不能夠滿足體內用量且免疫原性較強。

二、腺病毒載體腺病毒(Adenovirus)是一種線性無包膜的雙鏈DNA病毒,腺病毒的衣殼結構可以分為五鄰體和六鄰體兩部分,腺病毒的基因組主要包括病毒DNA復制前期的Ela、Elb、E2a、E2b、E3、E4(編碼病毒調節(jié)蛋白)和DNA復制后期的Ll~L5(編碼病毒結構蛋白),以及兩端的反向重復序列,ITRs(包裝所必需的順式作用元件)。

在天然腺病毒(主要是人5型腺病毒)的基礎上改造而得的腺病毒載體,其基因攜帶量增加,感染效率增加,且生物毒性降低。第一代腺病毒載體是刪除Ela、Elb基因的復制缺陷病毒,其復制必須在表達E1蛋白的細胞中,病毒滴度高且穩(wěn)定,不整合宿主基因組,但包裝量少(約為4.5kb),免疫原性強;第二代腺病毒載體進一步刪減病毒原有基因,在減少免疫原性和細胞毒性的同時,進一步提高載體容量,可以達到14kb,但是病毒滴度較低;第三代腺病毒載體則只保留了ITRs和包裝信號序列,因此其攜帶外源基因容量更大,約36 kb,但由于病毒包裝基因必須基因被刪除,第三代腺病毒載體工作組裝需要輔助病毒(表達腺病毒裝配必須基因),第三代腺病毒載體容量大,免疫原性低,但是量產困難,存在輔助病毒污染風險。

腺病毒感染力強、宿主范圍廣(分裂和非分裂細胞),表達迅速(24h-48h)且表達量高,包裝容量大,但腺病毒不能整合入宿主基因組內,規(guī)避了整合入宿主基因組的生物風險,安全的同時也形成了細胞分裂過程中不能均等分配給子細胞。腺病毒載體適合一般體外實驗,使用細胞類型較多,免疫原性較強,不適合體內實驗。

三、腺相關病毒腺相關病毒(Adeno-associated virus,AAV)是無包膜單鏈線狀DNA 缺陷型病毒,外包二十面體衣殼蛋白,基因組包括兩端的反向重復序列ITR(包含復制和包裝所需的唯一順式作用元件),中間的兩個核心基因:Rep 基因(編碼參與病毒復制、包裝和基因整合的蛋白),Cap(編碼結構蛋白VP1、VP2、VP3)。AAV為復制缺陷病毒,不能獨立存在,其復制增殖需要輔助病毒作用。衣殼蛋白不同的AAV病毒,對組織器官的親和力不同,形成各種AAV血清型:如AAV1較易感染骨骼肌,AAV6較易感染肺部,AAV8則親嗜肝臟,AAV9則為神經和外周組織(見后表)。

腺相關病毒載體(重組腺相關病毒載體, rAAV)的發(fā)展同樣在天然AAV的基礎上不斷優(yōu)化改進。最早采用重組載體質粒、目的基因質粒、輔助質粒、腺病毒共轉染細胞,步驟多、產率低、風險高;隨后采用目的基因載體、AAV基因載體(rep/cap)、輔助質粒(包含E1a、E1b、E2a、E4、VA等能完成腺病毒相似輔助功能的基因元件)共轉染細胞,但包裝效率低,生物風險高;Ad/AAV嵌合載體、輔助質粒感染恒定表達Rep/Cap細胞系的方法以及AAV生產細胞系法,這些方法均操作繁瑣;目前最常用的載體方法為Bac-to-Bac桿狀病毒表達系統(tǒng):將rAAV包裝組分AAV2的Rep基因序列、Cap基因序列、以及ITR-目的基因表達框的序列分別構建到三個桿狀病毒中,分別轉染昆蟲細胞Sf9各自擴增,然后通過共感染Sf9細胞來生產rAAV,該方法可以量產、成本低、操作簡單且不會對人體產生損傷。

AAV載體免疫原性極低,非常適合動物實驗,感染效率高,宿主范圍廣(分裂和不分裂細胞),不整合到基因組,穩(wěn)定表達持續(xù)時間長(半年以上),但是表達水平低且慢(細胞需要1周,動物需要2周),攜帶目的基因片段約為2kb。
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