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真菌基因組DNA提取試劑盒說明書

2022-03-04 14:30 作者:洛辰 來源:上海遠慕生物試劑

真菌基因組DNA提取試劑盒說明書
貨號:R2300
規格:50T/ 100T
保存:室溫(15℃-25℃) 干燥保存,復檢期12個月,2℃-8℃保存時間更長。

試劑盒內容:

  50T 100T
RNase A 1mL 1mL×2
蛋白酶K 1mL 1mL×2
玻璃珠 6g 11g
溶液A 10mL 20mL
溶液B 10mL 20mL
漂洗液 15mL 15mL×2
洗脫液 10mL 20mL
吸附柱 50個 100個
收集管 50個 100個
說明書 1份 1份

 













產品簡介:
    真菌是具有真核和細胞壁的異養生物,種屬很多,已報道的屬達1萬以上,種超過10萬個。真菌通常又分為三類,即酵母菌、霉菌和蕈菌(大型真菌)。對于酵母菌和霉菌,可以用玻璃珠處理,而對于大型真菌,可直接用液氮研磨。經過前期處理的菌液,用硅質膜吸附,即可得到高純度的基因組。提取純化后的DNA,可以直接用于 PCR/Real time-PCR,sequencing,Southern blot,mutant analysis,SNP 等下游應用實驗。

操作步驟:
    使用前請先在漂洗液中加入無水乙醇,加入體積請參照瓶體上的標簽。所有離心步驟均為使用臺式離心機在室溫下離心。
1、樣品的處理:
       1)對于酵母菌,取1-2mL培養好的菌液,離心收集,棄上清。加入200uL 溶液A,加入20uL RNase A,再加入100mg玻璃珠,在高速振蕩器上振蕩,約5-10min。
       2)霉菌(孢子也可相同處理):取50-100mg菌絲,加200uL溶液A,用玻璃研磨器適當研磨分散菌絲,加入20uL RNase A,再加入100mg玻璃珠,在高速振蕩器上振蕩,約30min。
       3)大型真菌(如蘑菇等):稱取50-100mg樣品,倒入適量的液氮,立即研磨重復3 次,使樣品研成粉末(如無液氮,可加200uL溶液A后用玻璃研磨器適當研磨),加200uL溶液A,加入20uL RNase A,再加入100mg玻璃珠,在高速振蕩器上振蕩,約5min。
2、 加入20uL的蛋白酶K(10mg/mL),充分混勻,55℃水浴消化30min,消化期間可顛倒離心管混勻數次。 12000rpm離心2min。將上清轉移到一個新的離心管中。如有沉淀,可再次離心。
3、在上清中加入200uL溶液B,充分混勻。如出現白色沉淀,可放55℃水浴5min,沉淀即會消失,不影響后續實驗。如溶液未變清亮,說明樣品消化不徹底,可能導致提取的DNA量少及不純,還有可能導致上柱后堵柱子,請增加消化時間。
4、再加入200uL無水乙醇,充分混勻,此時可能會出現絮狀沉淀,不影響DNA的提取,將溶液和絮狀沉淀都加入吸附柱中,放置2分鐘。
5、12000rpm離心1min,棄廢液,將吸附柱放入收集管中。
6、向吸附柱中加入600uL漂洗液(使用前請先檢查是否已加入無水乙醇),12000rpm離心1min,棄廢液,將吸附柱放入收集管中。
7、向吸附柱中加入600uL漂洗液,12000rpm離心1min,棄廢液,將吸附柱放入收集管中。
8、12000rpm離心2min,將吸附柱置于室溫或50℃溫箱放置數分鐘,目的是將吸附柱中殘余的漂洗液去除,否則漂洗液中的乙醇會影響后續的實驗如酶切、PCR等。
9、將吸附柱放入一個干凈的離心管中,向吸附膜中央懸空滴加50-200uL經65℃水浴預熱的洗脫液,室溫放置5min,12000rpm離心1min。
10、離心所得洗脫液再加入吸附柱中,室溫放置2min,12000rpm離心2min,即可得到高質量的基因組DNA。

注意事項:
1. 由于真菌種類萬千,對于一些特別難處理的真菌,可用液氮研磨,再用玻璃珠振蕩,蛋白酶K處理,一般都可以得到一定量的基因組DNA,如電泳檢測很弱,一般PCR都會有較好結果。
2. 若溶液A或溶液B中有沉淀,可在55℃水浴中重新溶解。
3. 如果DNA提取量很少,可加長玻璃珠處理時間,如果提取DNA成彌散短條帶,可減少玻璃珠處理時間。
4. 洗脫緩沖液的體積最好不少于50uL,體積過小會影響回收效率;洗脫液的pH值對洗脫效率也有影響,若需要用水做洗脫液應保證其pH值在8.0左右(可用NaOH將水的pH值調至此范圍),pH值低于7.0會降低洗脫效率;DNA產物應保存在-20℃,以防DNA降解。
5. DNA濃度及純度檢測:得到的基因組DNA片段的大小與樣品保存時間、操作過程中的剪切力等因素有關。回收得到的DNA片段可用瓊脂糖凝膠電泳和紫外分光光度計檢測濃度與純度。DNA應在OD260處有顯著吸收峰,OD260值為1相當于大約50 μg/mL雙鏈DNA、40 μg/mL單鏈DNA。OD260/OD280比值應為1.7-1.9,如果洗脫時不使用洗脫緩沖液,而使用去離子水,比值會偏低,因為pH值和離子存在會影響光吸收值,但并不表示純度低。
6. 在確保樣品無誤的情況下,如經過多次試驗,都無法提出DNA,請將部分樣品寄至我公司,我們代為摸索優化條件,以使您的實驗能夠正常進行下去。

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