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你知道核酸提取加蛋白酶K有什么好處嗎?

2022-09-21 9:59 作者:洛辰 來源:上海遠慕生物試劑
隨著新冠疫情的發展,新冠病毒核酸的檢測工作已趨于常態化。而優質的核酸提取試劑是核酸檢測的基礎,正確提取核酸才能保證下游檢測結果的質量。

市場上核酸提取的試劑成分雖然各有差別,但蛋白酶K由于其獨特的廣譜蛋白水解酶活性和穩定性,目前已成為了多種提取試劑的重要原料。另外,在臨床實踐中,特別是我國目前正在推行20混1檢測的場景下,難免會遇到復雜樣本(例如含有“痰液”的樣本);而蛋白酶K在處理特殊樣本時,更能突顯出作用。
蛋白酶K廣泛應用于核酸提取

蛋白酶K來源于林伯氏白色念球菌,是一種絲氨酸蛋白酶,具有較強的穩定性和廣譜蛋白水解酶活性,目前廣泛應用于核酸提取中。

01、【廣譜蛋白水解酶活性】

蛋白酶K可作用于多種蛋白,在病毒核酸提取檢測中發揮多重作用:

(1)裂解病毒的外殼蛋白,暴露核酸分子,并且病毒外殼蛋白失活可進一步保證運輸和檢測階段更安全;

(2)降解與核酸緊密結合的組蛋白,使得核酸游離到提取液中,有利于進一步純化;

(3)降解RNA酶,防止病毒RNA的降解,有利于核酸檢測。

02、【穩定性】

蛋白酶K能在多種環境[pH(4-12.5),高鹽緩沖液,70℃的高溫等]中保持活性。另外,蛋白酶K的活性不受SDS、尿素、EDTA、鹽酸胍、異硫氰酸胍等的抑制,且一定含量的去垢劑還可以增強蛋白酶K的活性。

03、蛋白酶K在新冠指南、政策文件均有推薦

學術指南和政策文件中,均提及蛋白酶K的應用。

早在2020年4月疫情暴發伊始,中華醫學雜志發布了《2019新型冠狀病毒核酸檢測專家共識》,提出收集痰液于采樣杯中,采樣杯里需裝入2mL蛋白酶K(1g/L)。

2020年7月13日,國務院發布了《醫療機構新冠病毒核酸檢測工作手冊(試行第二版)》,文中指出,如果痰液未收集于采樣液中,可在檢測前,加入2~3mL采樣液,或加入與痰液等體積的含1g/L蛋白酶K的磷酸鹽緩沖液將痰液化。

2021年5月,國家衛生健康委員會發布《新型冠狀病毒肺炎防控方案(第八版)》,文中提及處理痰液樣本時,可采用痰液等體積的含1g/L蛋白酶K的磷酸鹽緩沖液將痰液化。

04、相關研究提示蛋白酶K對復雜樣本核酸提取具有重要作用

新冠的核酸采樣主要采集口咽拭子和鼻咽拭子樣本,但在臨床實際工作中,難免會采集到一些復雜樣本,例如:痰液等。《2019新型冠狀病毒核酸檢測專家共識》中引用的研究[4]提示,在復雜樣本的提取核酸,使用蛋白酶K效果更佳。

在該研究試驗中,SungH等采用了蛋白酶K和其他兩種方法,提取痰液標本中的核酸(RNA),并使用熒光PCR儀對三種方法提取的核酸進行分析比較。試驗顯示,另外兩種方法提取核酸檢測結果中,假陰性率分別為16.7%和13.3%;使用了蛋白酶K處理的樣本,檢測結果并無假陰性。另外,蛋白酶K組PCR檢測的Ct值范圍在31.1-35.4之間,而另外兩種方法學PCR檢測的Ct值范圍分別為34.7-39.0和33.9-38.6。

另外,Saber Khelaifia等對糞便標本中的細菌DNA進行提取,結果顯示使用蛋白酶K可以提高DNA的提取量。Tomoo Jikuzono使用蛋白酶K對液基細胞溶液固定的甲狀腺細胞進行處理后,提高了RNA回收率。

蛋白酶K增加核酸提取量可能的原因為:

(1)復雜樣本(如:痰液樣本)中存在著一些可PCR反應的物質(可抑制PCR的物質,例如糖蛋白,免疫球蛋白等物質就是PCR的抑制物),使用了蛋白酶K可最大程度清除該類物質,保證PCR結果準確性;

(2)復雜樣本的核酸提取過程中,易殘留較多RNA酶,使用蛋白酶K可最大程度滅活RNA酶,防止病毒RNA的降解,有利于核酸檢測。

也有一些研究提示,蛋白酶K在復雜樣本的處理中并未顯示突出作用。這可能與使用的蛋白酶K活性不同有關,另一種可能是與使用場景有關,蛋白酶K加入裂解液之中,若作者長時間放置,蛋白酶K會失活,此時就會得到加不加蛋白酶K沒有作用的結論),未來仍需大量研究進一步探索。

目前,新冠疫情依然在全球肆虐,核酸提取檢測已趨于常態化。在臨床實踐中,特別是“10混1”或“20混1”檢測的場景下,難免會遇到復雜樣本(例如含有“痰液”的樣本);而蛋白酶K在處理特殊樣本具有獨特作用。未來我們需進一步深挖多種提取檢測使用場景,探索最佳使用方案,以期更好的控制疫情。
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