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遠慕分享:RT-PCR的定義與檢測方法

2022-10-18 11:33 作者:洛辰 來源:上海遠慕生物試劑
1.定義:是以RNA為模板,聯合逆轉錄反應(reverse transcription,RT)與PCR,可用于檢測單個細胞或少數細胞中少于10個拷貝的RNA模板。

RNA擴增包括兩個步驟: 在單引物的介導下和逆轉錄酶的催化下,合成RNA的互補cDNA;加熱后cDNA與RNA鏈解離,然后與另一引物退火,并由DNA聚合酶催化引物延伸生成雙鏈靶DNA, 最后擴增靶DNA。
2.檢測方法

⑴一步法:

利用同一緩沖液,在同一體系中加入逆轉錄酶、引物、Taq酶、4種dNTP直接進行mRNA反轉錄與PCR擴增。Taq酶不僅具有DNA多聚酶的作用,而且具有反轉錄酶活性,可利用其雙重作用在同一體系中直接以mRNA為模板進行反轉錄和其后PCR擴增,從而使mRNA的PCR步驟更為簡化。所需樣品量減少到最低限度,臨床小樣品的檢測非常有利。用一步法擴增可檢

測出總RNA中小于1ng的低豐度mRNA.該法可用于低豐度mRNA的cDNA文庫的構建及特異cDNA的克隆,并有可能與Taq酶的測序技術相組合,使得自動反轉錄、基因擴增與基因轉錄產物的測序在單管中進行。

⑵兩步法:

由于單管反應時RT和PCR都不能在最佳條件下進行并且 容易相互干擾,常只適宜用基因特異引物擴增較短的基因,及定量PCR.兩步法則是將RT和PCR分別進行,這樣使得兩個反應充分發揮各自的特點,更為靈活而且嚴謹,適合那些GC含量、二級結構嚴重的模板或者是未知模板,以及多個基因的RT-PCR。
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