原代細胞：從體內直接分離的細胞。功能、代謝、形態類似體內細胞的特點，因此原代細胞適用于分析單個細胞形態、代謝、功能。原代細胞的缺點是：細胞均一性差，因為從特定組織取下來的原代細胞可能處于不同的發育時期。增殖能力差、培養時間受限、轉染效率低。

細胞株：原代細胞經過長期培養和篩選后，功能、代謝、形態趨于均一化的無限增殖細胞。適用于整體水平實驗。優點是：容易培養、好感染、干擾因素少、便于同步化、實驗好操作。缺點是：與整體差別大、可能喪失原代細胞的特性，細胞株在長期傳代過程中遺傳物質發生變異。所以同一個學名的細胞株，有可能有完全不同的形態、代謝、功能表現。不同代數的細胞株，性質也可能完全不同。

原代細胞由于轉染效率低這個問題，應用受到了限制。自從腺病毒誕生后，因為其超強的感染能力，克服了原代細胞難感染的問題，使得原代細胞的使用變得更加簡單。由于細胞實驗后，很多時候需要做到動物體內，由于原代細胞有體內細胞的特點，為了細胞實驗和動物體內實驗的結果更加趨向一致性，因此用原代細胞來進行細胞實驗更值得考慮。