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遠(yuǎn)慕生物:觸發(fā)細(xì)胞死亡和炎癥的新機(jī)制:“左手殺手”

2020-04-02 14:16 作者:洛辰 來(lái)源:上海遠(yuǎn)慕生物試劑
“ Z-DNA多年來(lái)一直保持著神秘感。目前,我們研究其功能的唯一方法是研究能感知其功能的蛋白質(zhì)。我們?nèi)〉昧艘恍┻M(jìn)展,但是未來(lái)還有許多挑戰(zhàn),比如了解它們?yōu)槭裁矗诤翁幰约叭绾卧谝粋€(gè)細(xì)胞內(nèi)形成以及其目的是什么。” 
 

Z型核酸(Z-DNA)是具有不尋常的左手雙螺旋結(jié)構(gòu)的雙鏈DNA和RNA分子,與經(jīng)典的右手Watson-Crick雙螺旋相反。這種核酸是40多年前發(fā)現(xiàn)的,但迄今為止,我們對(duì)其生物學(xué)功能的了解仍然很少。

德國(guó)科隆大學(xué)CECAD衰老研究所的Manolis Pasparakis教授,與德州大學(xué)健康科學(xué)中心等處的科學(xué)家合作,研究了Z-DNA結(jié)合蛋白1( ZBP1),這是哺乳動(dòng)物中已知與Z核酸相互作用的僅有的兩種蛋白質(zhì)之一。以前顯示ZBP1可以感測(cè)某些病毒的遺傳物質(zhì),并誘導(dǎo)感染細(xì)胞死亡以防止病毒傳播。

但是奇怪的是,在他們較早的研究中,研究人員獲得的證據(jù)表明,在沒(méi)有病毒感染的情況下,ZBP1還可引起細(xì)胞死亡和炎癥。他們發(fā)現(xiàn),當(dāng)RIPK1(一種抑制ZBP1的蛋白)的功能受損時(shí),ZBP1被激活并引發(fā)炎癥性細(xì)胞死亡,這被稱(chēng)為細(xì)胞壞死(necroptosis)。

 

最新研究背后的一個(gè)關(guān)鍵問(wèn)題是在沒(méi)有病毒感染的情況下如何激活ZBP1。研究人員利用實(shí)驗(yàn)小鼠模型,發(fā)現(xiàn)ZBP1的促炎活性取決于其與Z核酸結(jié)合的能力,這表明ZBP1被細(xì)胞內(nèi)存在的Z型核酸激活。下一個(gè)問(wèn)題是ZBP1結(jié)合哪種類(lèi)型的內(nèi)源核酸。Pasparakis說(shuō):“我們可以證明ZBP1與雙鏈RNA結(jié)合。” “盡管我們目前缺乏實(shí)驗(yàn)方法來(lái)證明其具有Z構(gòu)象,但基于所有可用的結(jié)構(gòu)研究,我們對(duì)結(jié)果的解釋是ZBP1通過(guò)其Za結(jié)構(gòu)域與內(nèi)源Z-RNA結(jié)合。”

雙鏈RNA(dsRNA)在細(xì)胞中并不常見(jiàn),但會(huì)在某些病毒基因組的復(fù)制過(guò)程中形成,并被認(rèn)為在病毒感染期間提供了激活ZBP1的配體。科學(xué)家們推測(cè),細(xì)胞dsRNA可以通過(guò)內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄因子產(chǎn)生,內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄因子是來(lái)自古代逆轉(zhuǎn)錄病毒感染或活性逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子,以及“跳躍基因”,后者構(gòu)成了人類(lèi)和小鼠一半以上的基因組。

為了了解內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄元件作為dsRNA來(lái)源的可能作用,Manolis Pasparakis團(tuán)隊(duì)與Francis Crick研究所的George Kassiotis逆轉(zhuǎn)錄病毒免疫學(xué)實(shí)驗(yàn)室合作。他們發(fā)現(xiàn)實(shí)際上,對(duì)來(lái)自小鼠皮膚的RNA測(cè)序數(shù)據(jù)的計(jì)算分析表明,大多數(shù)互補(bǔ)的,推測(cè)為雙鏈的RNA均來(lái)自特定組的內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄元件。

這些發(fā)現(xiàn)表明,感知細(xì)胞dsRNA(大部分源自?xún)?nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄元件)激活ZBP1,誘導(dǎo)細(xì)胞死亡和炎癥,這一機(jī)制可能與人體炎癥性病理的發(fā)病機(jī)制有關(guān),尤其是在具有抑制ZBP1的蛋白質(zhì)(例如RIPK1)突變的患者中。

作者指出,“ Z-DNA多年來(lái)一直保持著神秘感。目前,我們研究其功能的唯一方法是研究能感知其功能的蛋白質(zhì)。我們?nèi)〉昧艘恍┻M(jìn)展,但是未來(lái)還有許多挑戰(zhàn),比如了解它們?yōu)槭裁矗诤翁幰约叭绾卧谝粋€(gè)細(xì)胞內(nèi)形成以及其目的是什么。”

一個(gè)特別令人著迷的方面是與內(nèi)源性逆向元件的聯(lián)系。 “目前對(duì)這些基因組附件如何影響我們的健康,知之甚少。似乎在進(jìn)化過(guò)程中,一些可以模仿病毒感染的逆轉(zhuǎn)座子被招募為有用的伙伴元件,應(yīng)對(duì)細(xì)胞對(duì)損傷,壓力或真正感染的反應(yīng),但這種伙伴關(guān)系也可能出錯(cuò),導(dǎo)致疾病。”

就像在病毒感染期間一樣,ZBP1感知內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄因子產(chǎn)生的Z-RNA,這可能會(huì)為細(xì)胞死亡和炎癥提供有效的誘因,導(dǎo)致疾病。不過(guò)這些研究還處于初期階段,我們還有很長(zhǎng)的路要走,未來(lái)了解其機(jī)制將有助于研發(fā)人類(lèi)疾病新療法。

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