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質粒轉化步驟

2020-09-14 11:14 作者:洛辰 來源:上海遠慕生物試劑

一.實驗原理

質粒可攜帶一種或多種抗生素抗性基因,其賦予攜帶它們的細菌對特定抗生素的抗性。研究人員可以通過人工選擇(即在抗生素存在下培養細菌),輕松地將含有該質粒的細菌與不含有該細菌的細菌分離。

Luria肉湯(LB)是一種富含營養的培養基,通常用于培養實驗室中的細菌。向LB中添加瓊脂導致形成細菌可以生長的凝膠,因為它們不能消化瓊脂但可以從LB內收集營養。向該凝膠中添加抗生素只允許選擇那些對該抗生素具有抗性的細菌 - 通常由攜帶抗生素抗性基因的質粒賦予。

LB瓊脂平板經常用于分離攜帶特定質粒的細菌的個體菌落。然而,液體培養物能夠支持更高密度的細菌,并用于培養足夠數量的細菌以分離足夠的質粒DNA用于實驗用途。

二.試劑及實驗器材準備

1.液體培養基配制:

胰蛋白胨Tryptone:10g

酵母粉Yeast:5g

NaCl:10g

dH2O定容至1000ml

2.LB平板配制:

胰蛋白胨Tryptone:10g

酵母粉Yeast:5g

NaCl:10g

瓊脂糖:12g(工作濃度6-25g/L

dH2O定容至1000ml

3.無菌平板(不可高壓):通常使用60 mm x 15 mm平板,200ml瓊脂澆筑4-5個平板(若瓊脂太少過夜孵育后容易干裂),可在其上單獨區分最多約100個菌落

4. Falcon細胞流式管(不可高壓)5.可高壓滅菌的燒瓶:(用1L瓶制備400ml瓊脂,在500ml瓶中制備200ml瓊脂,需要額外的空間防止沸騰。)

6.抗生素:1000倍的儲備溶液(氨芐青霉素鈉,庫存濃度100mg/ml,溶解后,0.22um過濾除菌,分裝,-20℃保存數月。加入培養基時一定要等滅菌后的培養基冷卻到40-50時再加入。含氨芐青霉素的培養基平板在4℃可保存2周。)
 

三.實驗步驟

1.溶解質粒: 含目的基因質粒的 紙剪下(比畫得圈稍大),并剪成碎片,放入無菌EP管,加20到50ul無菌水或TEbuffer, 可用槍頭將濾紙搗碎,室溫過夜(或為了促溶,還可60℃水浴)。后漩渦振蕩5min,離心,取上清即為質粒用于后續轉化。

2.LB液體培養基、LB平板粉末 攪拌溶解后,121℃高壓滅菌半小時,高壓滅菌過程中高壓釜膠帶會變暗。液體LB 無菌環境下冷卻至室溫,放置4℃冰箱備用;LB平板 熔融凝膠混合物在凝固前轉入40-50℃(視抗生素加入培養基溫度而定)水浴鍋,至少5分鐘,備用。

3.準備培養皿、Falcon細胞流式管,紫外線消毒30min;(在培養皿上標記日期、抗生素特性。)

4.準備抗生素(要制備終濃度為100 ug/mL氨芐青霉素鈉的平板,則應制備100,000 ug / mL(100 mg / mL)的儲備溶液。測量100毫克氨芐青霉素鈉粉末,將其加入1毫升水中,通過渦旋溶解,并過濾滅菌。)

5.添加抗生素至LB液體培養基、LB平板熔融凝膠混合物中(溫度不宜過高,40-50℃(視抗生素分解溫度而定,氨芐青霉素鈉加入溫度為40-50℃),防止抗生素分解)

6.澆筑LB平板:澆注后將盤子旋轉以除去氣泡,確保瓊脂在板底部均勻分布,凝固后倒置。200ml瓊脂澆筑4-5個平板(若瓊脂太少——板過薄,過夜孵育后容易干裂)若澆筑過程瓶中的瓊脂凝固,可再次通過高壓滅菌器或微波爐將瓊脂重新液化(用微波爐時防止沸騰!)室溫下固化大約需要30min,在室溫下過夜使之干燥。在過夜干燥后,將板在4℃下(用PE手套包好)儲存直至使用。

7.取感受態細胞置于冰浴中,如需分裝可將剛融化細胞懸液分裝到無菌預冷(提前冰上預冷1.5mlEp管)的離心管中,置于冰浴中

注意:一次轉化感受態細胞的建議用量為50-100ul,可以根據實際情況分裝。所用DNA體積不超過感受態細胞懸液體積的1/10。(根據加入質粒體積提前準備無菌10ul無濾芯槍頭)

8. 向感受態細胞懸液中加入目的DNA/ pUC19質粒(對照:證實感受態細胞是否有問題)(100ul的感受態細胞能夠被1ng超螺旋質粒DNA所飽和),輕彈混勻,在冰浴中靜置30min。

9. 將離心管置于42℃水浴中放置60-90s,然后快速將管轉移到冰浴中,使細胞冷卻2-3min,該過程不要搖動離心管。

注意:此步驟也可將離心管置于室溫進行,夏季或室溫較高時,可放置5-8min, 如果室溫較低,可延長時間至8-15min。條件允許建議使用42℃熱激方法。

10. 向每個離心管中加入900ul無菌的LB培養基 (不含抗生素),混勻后置于37℃搖床振蕩培養45 min (將1.5mlEp管水平放置,充分搖混勻),目的是使質粒上相關的抗性標記基因表達,使菌體復蘇。

11. 將離心管內容物混勻,吸取100ul (第一次涂板,可設置不同的梯度:20ul、50ul、70ul、100ul)已轉化的感受態細胞加到含相應抗生素的LB固體培養基上,用無菌的彎頭玻棒輕輕的將細胞均勻涂開。將平板置于室溫直至液體被吸收(15-20min),倒置平板,37℃培養12-16h(過夜)。

注意:涂布用量可根據具體實驗來調整。如轉化的DNA總量較多,可取更少量轉化產物涂布平板;反之,如轉化的DNA總量較少,可取200-300ul轉化產物涂布平板。如果預計的克隆較少,可通過離心(4000rpm, 2min)后吸除部分培養液,懸浮菌體后將其涂布于一個平板中。涂布剩余的菌液可置于4℃保存如果次日的轉化菌落數過少可以將剩下的菌液再涂布新的培養板。)

12. 使用無菌槍頭或牙簽,從LB瓊脂平板上選擇一個菌落。

13. 將槍頭或牙簽放入液體LB +抗生素中并旋轉。

14. 將細菌培養物在37℃下在振蕩培養箱中 180rpm孵育12-18h。

15. 孵育后,檢查生長,其特征在于培養基中的混濁霧度(見右圖)。

注意:良好的陰性對照是LB培養基+抗生素,沒有任何細菌接種。過夜孵化后,您應該看到這種培養物沒有生長。

對于細菌的長期儲存,選擇甘油

1、配制30%(體積分數)的甘油水溶液,離心管若干滅菌備用.

2 、將細菌用富集培養基搖瓶培養過夜,根據保藏要求(有些要求高的項目中菌要達到一定OD值)培養.

3 、將菌液和滅菌的甘油水溶液按照2:1的體積比例在離心管中混勻(使最終甘油濃度為10%,其實甘油多點也沒關系),-70°冰箱保存.

16. 用小提試劑盒從大腸桿菌培養物中分離質粒DNA。

17. 樣品進行電泳檢測:1%瓊脂糖凝膠電泳,上樣量為2ul,紫外燈下觀察,最明亮的帶為超螺旋形式,可以在一定程度上表明提取質粒的純度。

18. 質粒純化

1) 將之前提取好的質粒放入1.5ml離心管中,加入1/10體積的3mol/L無菌乙酸鈉溶液。

2) 加入2倍體積的無水乙醇,放置于-20℃沉淀4-6h或過夜。

3) 4℃,高速離心機14000rpm,離心20min.

4) 棄去上清,70%乙醇洗2次。

5) 空氣干燥,可置超凈工作臺干燥。

6) 加200ul無菌水溶液干燥后所得沉淀,即為質粒溶液。

7) 紫外分光光度計測量質粒濃度和產量。

四.提示和常見問題

(1)高拷貝質粒和低拷貝質粒有什么區別?

拷貝數是指單個細菌細胞內單個質粒的拷貝數。大質粒通常具有低拷貝數(每個細胞大約一個或兩個拷貝)并且它們需要生長更長的時間段(大約18-30小時)。另一方面,較小的質粒可以大量存在,每個細胞50個或更多,并且具有高拷貝數。高拷貝數質粒應該僅需要平均生長12-16小時。無論質粒大小如何,質粒的某些特征可使其低拷貝。請參閱質粒的信息頁面以確定您的質粒是高拷貝還是低拷貝。

(2)過夜孵化后,我沒有任何增長。什么地方出了錯?

嘗試將文化培養更多時間。一些細菌培養物生長得更慢。此外,在30°C而不是37°C溫育的細菌通常需要更長的孵育時間。

仔細檢查LB培養基中的抗生素是否與質粒上的抗生素抗性相匹配。

如果LB瓊脂平板上的細菌不是新鮮的,你應該將細菌劃到新的LB瓊脂平板上,然后在液體培養基中生長。

更多的曝氣可能有助于增加培養物的密度。通常培養物在150-250rpm下搖動,將其增加至350-400rpm以獲得更高的細胞密度。

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